皮山縣轄6個鎮(zhèn)、10個鄉(xiāng)（包括2個民族鄉(xiāng)）：固瑪鎮(zhèn)、杜瓦鎮(zhèn)、闊什塔格鎮(zhèn)（2015年）、克里陽鄉(xiāng)、科克鐵熱克鄉(xiāng)、桑株鎮(zhèn)（2016年）、木吉鎮(zhèn)（2013年）、喬達(dá)鄉(xiāng)、木奎拉鄉(xiāng)、藏桂鄉(xiāng)、皮亞勒瑪鄉(xiāng)、皮西那鄉(xiāng)、巴什蘭干鄉(xiāng)、賽圖拉鎮(zhèn)、垴阿巴提塔吉克民族鄉(xiāng)、康克爾柯爾克孜民族鄉(xiāng)。